在航海途中，黑死病就开始发作，惊恐的船员们将死者抛入大海，同时愈发急切地渴望回家。
于是，在1347年10月，随着这十二艘死亡之船的到访，西西里岛北部的港口城市墨西拿，就成为了第一个被黑死病攻陷的意大利城市——不到一周之内，瘟疫就像海啸一样，淹没了这座可怜的城市。
那些染病的人，最初会在鼠蹊间或是在胳肢窝下隆然肿起一个瘤来，到后来愈长愈大，就有一个小苹果或是一个鸡蛋那样大小。医生们管这瘤叫“疫瘤”，不需要多少时间，这死兆般的“疫瘤”就由那两个部分蔓延到人体各部分。这以后，病征又变了，病人的臂部、腿部，以至身体的其他各部分都出现了黑斑或是紫斑，有时候是稀稀疏疏的几大块，有时候又细又密。不过这都跟初期的毒瘤一样，是死亡的预兆。再往后，就是高烧、溃烂、恶臭，有的人还吐血，呼吸中往往带着一股血腥味，就好像体内的血液在腐烂。
而且，任凭惊恐的病人们怎样请医服药，这病总是没救的。这在当时的欧洲根本就是一种不治之症。总而言之，凡是得了这种病之后还能侥幸治愈的人，真是极少极少，大多数病人都在出现“疫瘤”的三天以内就送了命。更要命的是，这种黑死病的传染性极强，健康的人只要一跟病人接触，就染上了病，那情形仿佛干柴靠近烈火那样容易燃烧起来。甚至只要接触到病人穿过的衣服，摸过的东西，也有染病的危险。
最后，绝望的人们采取了最严酷的隔离手段，由于隔离病人已经来不及，幸存的人只好隔离自己。他们储备了大量水和食物，躲在屋子里闭门不出，只是整天没日没夜地向上帝祈祷。可即使是这样，他们之中的绝大多数人还是没能逃过死亡，因为不知疲倦的老鼠们，会把病菌从一座屋子传播到另一座屋子……
面对着这样一场空前惨烈的天降横祸，惊恐的墨西拿市政当局群情激奋，不顾触怒西地中海霸主热那亚共和国的危险，勒令这十二艘带来死亡的热那亚商船火速离开。
热那亚水手们沉默地起锚出航了，而墨西拿人却还得继续慢慢地等待死亡——铺天盖地的死亡还在不断降临，吞噬了城市的每一条大街小巷，贵族和富商们逃走了，士兵、神职人员和市政工人统统消失无踪，满街都是无人收敛的尸体。成千上万的野狗在无人的街道上游逛，它们撕咬尸体、吞吃腐肉，吃人吃得眼冒红光，犹如地狱三头犬一般凶残……不到一个月之后，整座城市彻底毁灭了，秋日的艳阳下，全城宛如死一般的寂静，无数残缺不全的尸体躺在大街上静静地腐烂，整座墨西拿城也在跟着一起腐烂。
而接下来静静腐烂的，则是整个西西里岛——这一年的秋天，黑死病的阴霾席卷了西西里岛上的每一座城市，一遍又一遍地复制了墨西拿城的惨祸，把这个岛屿变成了死神统治的黑暗国度。
然而，那十二艘死亡之船的故事，却还没有结束。
墨西拿和西西里岛充其量不过是这场噩梦的开胃菜，死神随着船队继续向欧洲大陆挺进，先是在比萨港短暂地停留，随即很快抵达了这支船队的母港，地中海上的商业明珠热那亚。
由于消息传递的滞后，不知底细的祖国张开怀抱欢迎了这些远方的游子，但在几天之后，就又惊恐万状地将它们强行驱逐，并且在恐慌中下令封港，外来船只凡是有敢入港的，一律击沉——可惜为时已晚：接下来的时间里，数以万计的热那亚市民丧命，而当时热那亚的全城总人口也不过十余万。
从此，无法阻挡的死神就从墨西拿、热那亚和比萨三个桥头堡出发，犹如飓风和海啸一般，迅速席卷了整个意大利半岛，这个文艺复兴时代全欧洲最繁华、最富庶、最文明、最进步的地方。
再回到那十二艘热那亚人的死亡之船：到得此时，关于死亡船队的噩耗已经传遍了整个意大利，从阿尔卑斯山到撒丁岛，没有一个港口愿意接纳这些死神的使者。最终，这支船队继续扬帆北上，于1348年1月来到了法国海岸——虽然当地的市政官员已经得知了瘟疫的消息，并且在港口拉起了粗大的铁链，但最终，面对着船上那一群热那亚孤魂野鬼的绝望乞求，又并未亲身体会到黑死病的危害之酷烈，浪漫与宽容气息浓厚的马赛港当局还是接受了它们，也把黑死病这头恶狼引入了法兰西的家门口。
当居住在郊外庄园里的穿越者李维骑士，愕然得知此事之时，一切都为时已晚。
尽管只过了短短几天，在亲身体验了一番黑死病的滋味之后，全副武装的士兵就冲进马赛港的码头，强行驱逐了这十二艘死亡之船。但黑死病的魔掌已经侵入了法国的土地：虽然法国人已经知道要预先隔离患病的水手，可是却拦不住船上的老鼠悄悄跑到岸上进入民宅和仓库。而这些小东西身上的跳蚤，则是比患病人类更危险的病菌携带者……死神成功溜进了马赛港的大街小巷，开始了恐怖的大屠杀！
被马赛港的法国驻军强行驱逐之后，这支死亡船队的旅程居然还没有结束，尽管水手们正在纷纷死去，它们还是继续向西挺进，顽强地漂流到了西班牙，在伊比利亚半岛的海岸线上肆意播洒死亡……再往后，它们终于从历史记录之中彻底消失了，没有人知道它们的结局，或许船上的水手真的都死光了。
但死神赋予这支船队的使命，也已经被圆满地完成了——它们成功地将瘟疫播洒到了整个欧陆！
而在法兰西的土地上，第一个被黑死病毁灭的对象，就是李维。培根骑士一家居住的马赛港！