此后人教（太上老君所创，门下玄都大法师、上洞八仙等）、阐教（元始天尊所创，其弟子有云中子、十二金仙等）、截教（大弟子多宝道人，无当圣母等等）兴起。接引道人演沙门，立西方教，接引道人即为佛主阿弥陀佛，准提道人则为二教主。女娲的妖教则随巫妖大战泯灭。
三清继承盘古大弟子名号，是为亲传弟子，三清各自所创的人教、阐教、截教合在一起称为盘古正宗，也称玄门，后统称道教。
人间界仍有大巫部落，视妖族、人类为一族（人为女娲所造），人巫大战仍是不休。九黎部落蚩尤举部落之力，以巫族秘术造十二都天神煞大阵，欲聚十二祖巫之灵为己所用。但人教大兴，轩辕拜师于广成子（广成子为阐教十二金仙之首），广成子助轩辕杀蚩尤，灭其部落，轩辕遂为人皇。
其后，轩辕孙颛顼氏又伤巫族首领九凤，灭其族。至此，巫族不成气候。至大禹时，人教达顶峰。后大巫白起被真武荡魔大帝化身徐福用计镇压进山河社稷图，大巫嬴政与勾陈双双身陨，此后，人间界巫族几乎销声匿迹。
人间界经巫妖大战后，被打碎成无数块，散落成宇宙，再也不能合拢。六道轮回附近，因太阳星、太阴星残存下来，碎块形成地球，因被阴阳滋润，故有灵气。人间界居民剩余大部分仙、妖、人中，有神通者俱都搬往地仙界，与早先移民过去的居民共居地仙界，有大神通者纷纷开宗立派，地仙界中修行成风。而散落于洪荒深处的居民，因路途无限遥远，却回不来了。东皇太一身损后，三清推举鸿钧身边童子童女为天庭玉帝、王母娘娘。巫妖大战后，阿修罗一族出幽冥血海，在地仙界、人间界传下道统，为阿修罗魔教，亦名大乘魔教。偏颇教义的法门，结合了巫法、妖术，仙法，为小乘魔教。
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