祖家军上下自成体系，在晋朝时，即便主力一度被改编为中军，但除非负责宿衞的部分，否则也只听祖逖一人之命，尚书省是根本插不进手去的。但既然华晋禅代，祖逖又臣从了裴该，自然不可能再沿用旧例，裴该对于保证其军的完整性给出了承诺，祖士稚自然也不得不做一定程度的让步。
首先是要按照朝廷的军事体系重新编组，增加排、部、旅三个层级，排以上将吏名单都须上报枢密省备案；其次于队以上各级设置司马，一方面核实功过，另方面进行政治宣传，这些司马多数由祖军自行任命，但也有将近三分之一是洛阳委派的；其三，军中律令，改从关中军旧制——当然啦，其实差别并不是太大。
至于其四，于收复失土，各郡县乃至亭的守吏，祖逖有署任权，但须报尚书省备案，尚书省亦可因应情势，加以更替。
原本在晋时，裴军在西，祖军在东，各练各兵，各打各仗，名为守望相助，其实相互间的联系并不紧密。既归华朝，就不能再这样了，华廷自然会徐徐地往祖军中塞人、掺沙子，以期逐步加以掌控。对于祖逖来说，你只要别太过份，别影响到我的对羯之战，虽感不满，也只有捏着鼻子认了。
正因为如此，对于前线将兵，或者祖逖本部，华廷还不便也不敢过多地伸手，而于屯河内的李矩、驻枋头的魏亥，人员安插和调动就相对要频繁一些——李、魏二人皆为故晋旧将，原本就不是祖家军的核心人马，二将也因此颇有改换门庭的想法，故于枢密省的安排并无异议。
即以魏亥论，他的旅司马，以及其下三位营司马，就全都是关西人；此外枢密省还以其旅数量不全为由，新塞了五百多关西老兵进来。然而司马普遍比各部主官要低两级，魏亥为少将，其旅司马则是上校。
故而此际得报：“枢密省兵部侍郎杨清奉诏来到……”魏亥就不禁诧异啊，心说一部侍郎为正四品，军衔大校，但我知道这个杨清，他迎娶了皇后义妹，封襄邑县侯，乃是天子心腹，本衔少将，以高品而“行”兵部侍郎。这家伙跟我同品，爵位还比我高一级，他到前线来干什么？难道是朝廷欲罢我之职，而以杨清代之吗？
心中忐忑，赶紧出营相迎。
只见一队人马列于营前，当先一将，见魏亥出来便即下马，倒执马鞭，拱手道：“足下可是魏将军么？末乃杨清。”
魏亥上下打量杨清，就见此人年纪很轻，估摸着还不到三十岁，与郭诵差相仿佛，却比自家为小。虽说也是行武出身，但或许这几年一直安坐后方的缘故吧，杨清肤色颇为白皙，和魏亥、郭诵这种久在军中，常冒风霜烈日的将领，一眼就能区分出来。
杨清未穿甲胄，身上是一套黑质镶红的戎服，腰围金带，佩着紫绶。至于头上，则戴了一顶黑色的皮弁，正中央镶嵌着一枚五角金星……
魏亥不禁心说，这打扮很威风啊，我也应当去置备一套。
魏晋时军将，与文吏相同，都规定了四时之祭服、礼服，却并未规定常服，所谓上身褶衣、下身长裤的戎服，多不是在正规场合所可穿着的。理论上要到晋安帝时代，才下诏：“诸侍官戎行之时，不备朱衣，悉令袴褶从也。”武官，或者文官行武事时，才算有常服制度。而在此之前，武将于军中并无统一服色，往往是怎么穿着舒服就怎么来。
华朝则只定一套祭服，和一套公服（合礼服与常服为一），但新建制度，自然不可能下令全军即刻换装——光换旗帜就是一个大工程了——朝廷只是赏赐了祖逖一套常服而已，魏亥等将则还来不及置换。此外按制，元帅、元戎当配金钺盔饰，各级将校以金银等做星形盔饰，尉官以铜做扣形盔饰，以别上下、明号令，但祖逖认为这纯属浪费金钱的面子工程，他素来俭朴，乃不即配，上行下效，魏亥等自然也不敢配了。
故此魏亥今日见杨清袴褶精神、金星煌煌，不禁眼热，相比起来，自家虽然着甲戴盔，却象是个乡巴佬了。当下听得杨清询问，面色乃微微一变，旋即恢复正常，拱手道：“末将正是魏亥，恭迎杨侍郎。”
杨清多敏的人啊，当即笑着一摆手，说：“魏将军在军中，想是尚未来得及制服。正好，朝廷赏赐将军一套公服，命我携来。”身后当即有小吏捧着具木匣疾驱而前。
杨清道：“可先入营，将军易了服，再来听杨某宣诏。”
魏亥忙将杨清等一行人接入营中，随即告罪请杨清稍待，他自己跑后面换衣服去了。过不多时，身着袴褶，足登皮靴，一手捧着皮弁，一手摩挲着其上的金星，转归正堂，等进门后才忙不迭地把弁给戴起来。
对面一站，双方打扮相若，两颗金星相向闪耀，魏亥还比杨清要高出半个头去——他这才感觉通体舒泰。
而且趁着换衣服的片刻时间，魏亥也想明白了，固然杨清是天子近幸，终究未闻立过什么显赫的功劳啊，他一直在后方坐办公室呢。则若朝命使杨清替我，我就说军情方急，所任不可非人，把官司直接打到祖元帅面前去，多半还有转圜的余地……
杨清取诏来宣读，倒没有什么骈四俪六，文意还算浅显，魏亥大致能够听得懂——原来是天子特命杨清到枋头来，协助魏亥调配粮秣物资的，并非要夺他的兵权。
魏亥这才把心放落肚中，就要下令摆宴为杨侍郎接风。杨清却摆手道：“此非饭时，何必摆宴啊？还是公事要紧。”旋即问道：“河道近日不甚通畅，导致粮运须走陆路，损耗既大，行进又迟缓，此事魏将军可知道了么？”
魏亥苦笑道：“魏某正为此事焦虑。祖元帅方与羯贼对战于三台，军中日耗粮近五百斛，每日催促，而若西方之粮不能及时输至枋头，恐怕于軍争不利啊……”
杨清就问了：“如今枋头存粮，尚有几许？”
魏亥虽然不是专搞后勤的，但既奉命护粮，于存粮数目须每日核点，自然也是清楚的，当即回复道：“不足两万斛，最多可资一个月。”