实际上，相对于文官集团，军队内部的派系斗争甚至出现得更早。在现在的汉军之内，仅在陆军之中，以赵广元为首的从龙系、以马英为首的辽东系和以张勇、赵良栋、王进宝、孙思克为中坚的降将系三足鼎立，彼此泾渭分明，站队毫不含糊。
虽然到现在为止，还没有发生彼此拆台的事情，但在大小事情的处理上，譬如军械补给、军官的提拔任用或者防区地盘的划分等等，那都是有“老军门”的“栽培爱护”，各有各地靠山，平时开个会，大家寒暄热闹，笑容满面，兄弟长哥哥短，但若是认真了朝心裏去，那也是人人心裏都有本帐。
这种派系局面说严重，那也似乎没什么了不起，至少绝对没有发生叛乱的可能；但若是说不严重——放眼一看，简直触目惊心，几乎蔓延到了军队中的各个角落，甚至连军校也是如此：马庄武学是从龙系的根据地，丰台学兵大营是辽东系的地盘；而保定士官学校则是降将系的老巢，各派人马心照不宣，彼此井水不犯河水。
作为皇帝亲兵的近衞军自然也同样如此，瑞克的近衞第一军，毫无疑问，自然是从龙系的代表；赵应奎的近衞骑二军、王忠孝的近衞骑三军，那就是辽东系效忠陛下的铁证；排到马进良的第四军、于成龍的炮兵第五军，那就证明降将系对皇帝的耿耿忠心了。
甚至连海军也是这样的三角平衡架势。
其实在很早的时候，海军之内还只有两派，一派是降将系施琅；另一派则是从龙系王大海，两者分别执掌一支舰队，彼此秋色平分，颇为完美，但随着帝国的扩张，新进加入的辽东系慢慢成长壮大，成为军方支柱之后，却一直没有机会把势力延伸到海军中去，故而对此极度不满，幸好，在产生严重矛盾之前，林风就察觉了这种趋势，所以就从辽东系中精心挑选了一批军官搭起了第三舰队的架子，以南洋作战的名义拨出巨款，在大连、秦皇岛进行增补和训练，直等到远征军归来之后，就顺理成章的任命慕容鹉为海军准将，成立海军陆战部队，与施琅、王大海两系平衡。
可以说，对于军队的稳定、势力派系的平衡和安抚，林风可谓是煞费苦心，从汉军成立之日起就开始小心经营，从无到有，由小入微，战战兢兢，不敢有一日轻忽，既要做得小心翼翼、不偏不倚，又要不动声色、光明正大，好教旁人看上去风平浪静、一派祥和。
三大军系之中，各派的实力彼此相当——当然，林风也不可能让某一派出现独大地现象，不过三派之中，却各有各的特点。
所谓从龙系，自然就是以最早跟随林风打天下的那批人为基干，他们的优势就在于与皇帝关系密切，亲信宠爱，也是出镇封疆大吏最多的一派，走的是上层路线，势力强大，地位稳固；
辽东系则靠的是实力，这批马贼出身的将领大多彪悍生猛，而且擅长骑兵战术，可以说，现在大汉帝国之中，百分之七十的精锐铁骑，都由掌握在他们的手中，帝国若是要打仗，必定是“首战用我，用我必胜”，而且同时也是帝国功勋柱石，皇帝不失亲近，倚重多多。他们走的是中层路线，实力强大，不可或缺；
而降将系，那就是胜在人数众多了，大江南北，同年不计其数，彼此呼应，自成一派，遍布朝野，不动则已，动一发则牵全身，同时和各地地方有着千丝万缕的关系，甚至不少军官本身就是军阀和地方实力派出身，而派内几个老大，如张勇、赵良栋、王进宝、孙思克、罗盘根、马鹞子、王屏藩、旁大疤子等也都是能打硬仗的狠角色，挑得起大樑，不怕别人为难。他们走的是下层路线，声势浩大，关系帝国根基，无人轻侮。
以从龙系稳定辽东系，再以从龙系和辽东系驾驭降将系，三者相互钳制，同以皇帝为最后根本，这种平衡贯穿了林汉帝国崛起和发展和始终，但却并非阴谋和算计，而是阳谋，是帝王之术，从某种意义上讲，也正是林汉帝国政治构架中最核心的一部分。
而相对于军方势力，文官集团这一块，那就要复杂得多了。
其实这一点也不奇怪，就中国数千年历史来看，文人政治中的花样从来就要比军人多，而林汉集团的文官政府组成比军队建设还要复杂。
起初林风杀入北京的时候，是没有文官的，唯一一个能够担任文官角色的周培公，却一直都是不折不扣的军人，从来没有干过文官的事情，所以，若是从人员成分上分析，大伙儿都是一派，都是从前伪清朝廷里投降过来的降官，包括李光地、陈梦雷在内，大哥甭笑二哥。
一般说来，在一个政权之内，投降者出身的官员从来就是矮人一头的，有着先天不足的缺点，但是，在林汉帝国这一块，就没有这个问题了，因此，文官集团之中从来就没有什么降官系，大家彼此彼此，不过这也并非是好事情，因为大的矛盾一去，各种各样小的矛盾就纷纷应运而生了。
实际上，甚至就连林风自己，也都不太清楚自己这个朝廷里到底有多少文官派系，这些乱七八糟的小圈子比比皆是，按下葫芦起来瓢，根本无从谈起。
按照权力体系来看，大批官员自然是依附李光地，不过各部尚书以及陈梦雷也都有自己的一票人马，势力不小；按照地域上来分析，李光地和陈梦雷都算南方派，而六部尚书以及不少地方的巡抚，譬如于成龙、汤斌之类算北方派；按照彼此之间的交情来算，又可以划分出若干个大大小小的小圈子；按照从前朝伪清中的出身来看，还有顺治朝官、康熙朝官，甚至还可以细分到某某年同年；而除了这些，大家彼此的学派、所持的政见又有许多不同，有保守派、有激进派、有和稀泥等等，圈子还可以再划上一划。
总而言之、言而总之，文官那边简直就是一锅粥，彼此矛盾，彼此斗争，同时又彼此联合。但是总体上来说，仍然还是李光地一系势力最为强大，到底是内阁首辅大臣，朝内首屈一指，无人可与之并肩。
但是，每一派集团都有着他自己的利益，或为本部门，或为本地方，或为本派系，或为本学派，倾轧和争斗永远不可避免。在林风这种强势皇帝的威权下，就算是李光地，也不可能做到权倾朝野，别人不敢开声的地步。
这种文官集团内部的倾轧和争斗，在每一年的财政预算分配上，表现得最为激烈和明显。