英国人以己度人，断定也许为菲律宾人站台的可能不是美国政府，但也一定是美国几家大的石油公司。

为了抵挡美国人对文莱石油的窥视，英国政府决定还是将沙巴塞给马来亚联合邦，为此，英国人向东古·阿卜杜勒·拉赫曼为首的巫统提出合并意见，即要新加坡可以，连带着把沙巴一起接手过去，决不能只要其中一个。

尽管英属北婆罗洲当时只有30万人口，并不影响马来人在马来亚联合邦的绝对多数，但沙巴的经济极其落后，对于同样贫苦的马来亚联合邦来说是一个沉重的经济负担，完全抵消了得到新加坡后的好处，因此，东古·阿卜杜勒·拉赫曼甚是犹豫。

结果还没等巫统给出答覆，英国欲将把沙巴交给马来亚联合邦的消息便已经走漏，曾经镇压过菲共胡克运动的菲律宾总统拉蒙·马格赛赛勃然大怒，于是一方面让菲律宾驻英国大使向英国政府提出严正抗议，另一方面组织和操纵了北婆罗洲国民军等游击队实行武力夺权。

面对北婆罗洲突然而来的乱局，英国一面调集在北婆罗洲的驻军实施武力清剿，另一方面则加速敦促巫统做出回答，同时老谋深算的英国政府还拟定了文莱兼并北婆罗洲及加里曼丹共和国合并北婆罗洲的两个后备预案。

1957年3月1日，巫统正式答覆英国方面，宁愿放弃新加坡也不愿意兼并沙巴，而文莱皇室也被北婆罗洲国民军的袭击搞怕了。

沙巴国民军甚至跑到文莱皇宫外搞刺杀。

所以一口回绝了英国的提议，只有加里曼丹共和国因为无法摆脱壳牌公司掌握的缘故，很不情愿的同意合并北婆罗洲。

4月20日，英国政府与加里曼丹共和国签署协定，正式向向加里曼丹移交北婆罗洲。

为了从菲律宾人手中保衞住沙巴，加里曼丹政府随后被迫在三年内向中国进口了100万移民，以此摊薄土着人口在沙巴的比例，并引入中国势力干预菲律宾人的扩张。

与此同时，加里曼丹政府还不得不将原来只有1万人的加里曼丹国防军扩大一倍，并将其中的1.3万人布置到了沙巴地区，借此威慑和镇压沙巴国民军的活动。

5月11日，马来亚联合邦进行了第一次全国普选，选举产生了100名马来亚联合邦国会议员（含22位上议院议员和78位下议院议员。另有16位上议院议员不经选举由为马来亚联合邦元首钦定产生）。

其中马来亚华人公会党赢得了槟城、马六甲等2个州和吉隆坡特区的选举胜利，一共为马来亚华人赢得了1个部长职位、4名上议院议员和8下议院议员。

5月28日，全体马来亚联邦国会议员齐聚首都吉隆坡特区，由时任马来亚联邦最高元首的端古·阿卜杜勒·拉赫曼（兼任森美兰州苏丹）和总理东古·阿卜杜勒·拉赫曼（吉打州苏丹之子）在市政广场正式宣布马来亚独立。

马来亚独立的第二天，英国政府宣布新加坡由殖民地升格为自治邦，英女王仍为新加坡最高元首，英国政府委任的新加坡总督代行新加坡元首权力，负责新加坡的防务与外交，原新加坡城市议会改为新加坡自治邦议会，51名议员全部改为民选，议会的多数派将组成新加坡自治政府，政府首脑为新加坡总理。

1957年7月1日，根据25万新加坡选民的投票结果，新加坡劳工阵线获得15个议员席位，成为新加坡第一大党，人民行动党获得6个议员席位，成为新加坡第二大党，新加坡发展党、新加坡华巫联盟，以及新加坡民主党各获得4个议会席位。

而新加坡自由党获得3个议员席位，此外还有工党等8个小党获得了议会中的席位，另有4个以人名义参选的候选人成功成为首届新加坡自治邦议会议员。

鉴于参选各党都没有获得新加坡自治邦议会过半数的席位，所以由第一大党劳工阵线出面组织联合政府，劳工阵线副主席林有福。

劳工阵线主席大衞·马绍尔是英国人，因此，不受到新加坡华裔议员的欢迎，所以由福建裔草根政治家林有福出面组阁。

担任新加坡自治邦第一任总理，新加坡发展党、新加坡华巫联盟、新加坡自由党、新加坡社会制度党、新加坡印度人党等党派派人参与联合政府。

但以李哈利为党首的新加坡人民行动党却拒绝以议会第二大党的身份加入新加坡自治政府，反而联合工党、新加坡国民党等部分党派及少数个人议员组成新加坡反对党联盟，从此与执政联盟形成长期政治对抗……