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浩罕汗国对新疆的入侵得到了喀什噶尔、英吉沙尔、喀喇沙尔三城阿奇木伯克的响应，叶尔羌、和阗、阿克苏的阿奇木伯克则宣布独立，并派人要同浩罕汗国结盟。

浩罕汗国的入侵，新疆回部的叛乱，让宁夏、甘肃的一些教徒以为建立一个伊斯兰教国的机会来了。从浩罕汗国刚刚传入中国的新教徒们，发起了屠汉叛乱。

共和国统一全国之后，虽然废除了旧清一些歧视回民的政策，但是共和国除了大力发展联通各地的铁路和公路建设以外，同样制定了不许宗教干涉地方事务的规定。

共和国的规定无疑是剥夺了甘肃、陕西、宁夏等地清真寺对于教众的管理权力，对于各清真寺的教长来说，他们感觉自己的权力受到了侵犯。

而甘肃、陕西、宁夏等地在共和国建立时，基本上都是和平归顺于中央的，因此在这些地方的驻军并没有进行大规模更替。在当地回民眼中，共和国和清朝似乎并没什么区别。

因此当新疆回部叛乱的消息传来之后，宁夏金积堡地区的新教回民首先发动了叛乱，他们一边大肆屠杀周边的汉村，一边举起了独立建国的口号。

由于当地汉人遵守法律，没有私藏武器。而以清真寺为领袖的回民聚落，一向保持着半军事化的组织，回民一叛乱就占据了上风。短短半个月内，宁夏、甘肃近10多万汉人被屠杀殆尽。

虽然开通了铁路，但是尚没有有线电报的中国，当甘肃、宁夏回民叛乱之后，北京才得到了这个消息。

对于参与过新法兰西对印第安战争的林盛和等人来说，对于这种民族叛乱是最为敏感的。

林盛和召开了紧急的国民会议，在会议上他并没有先报告平叛的各项事宜，而是要求国民会议通过一项法律，剥夺参加叛乱回民的共和国国籍。

议长陶澍大为吃惊的问道：“总统先生，现在我们不是应该优先讨论如何平叛，然后再对叛乱的回民进行处置的吗？”

林盛和表情严峻的说道：“这不是一次叛乱，这是共和国各民族的敌人企图屠杀共和国人的阴谋，对于同浩罕汗国勾结的回民，他们已经不能再享有共和国法律的保护。如果在这一点上不做出澄清，那么共和国的军队将会在接下来的战争中失去方向。”

国民议会的议员们并不了解林盛和是什么意思，不过为了能尽快回到平叛的事项上来，很快他的提议就被通过了，共和国的议会做出决定，叛乱的回民不再受到法律保护，同时所有服从于共和国法律的清真寺，都必须改为用中文传教。

原本在山西集结的，准备用来在外蒙古驻军的5万部队，改变了方向，转道陕西进入甘肃、宁夏平乱。而驻扎在包头的骑兵第1、3、8师也向西进入甘肃、宁夏平乱。

共和国的军队刚刚进入陕西时，就听到了又一个坏消息。因为甘肃、宁夏的民族大屠杀，导致陕西民众对于当地回民产生了不信任感，因此陕西各地的汉人士绅要求当地政府收缴回民的武器。

陕西黄河以北地区的回民人数不多，对于这场叛乱和建立伊斯兰国并不感兴趣，在得到了地方官员保证回民村落的安全之后，就顺从的交出了武器。

而靠近甘肃、宁夏地区及关中平原地区，因为回民村落众多，加上害怕武器被收缴之后，引起汉人村落的报复，因此拒绝交出私藏的武器。

在甘肃、宁夏地区清真寺派来的教徒的诱惑下，临潼的回民村落第一个发起了叛乱，此时刚好一只陆军部队正奉命从三门峡前往西安，加强西安的防御工作。

当地回民的叛乱，很快被这只过路的军队镇压下去了。不过县城以外有十多个汉人村落被屠杀殆尽。

被击退的回民武装，仓皇的逃过了渭河，向宝鸡退去。在逃亡的途中，他们不断的勾连回民，对逃亡途中遇到的汉人村落进行屠杀。一方面是为了获取粮食等物资，一方面则是迫使周边的回民村落在害怕被汉人报复下，加入回民的叛乱中。

一时之间关中平原上烽火处处，这些陕西回民以为只要聚集起足够的力量，就能抵御住中央政府的清剿，进而迫使其进行谈判。

原本作为外蒙古驻军司令的乌长风，在新法兰西同印第安的战争中，就被称为屠夫。

林盛和正是看重了他的刚强和冷酷的性格，才准备用他来威慑那些在俄国和共和国之间摇摆不定的蒙古王公们。

但是事发突然，驻蒙军不得不得不进入西向平叛。刚刚进入陕西时，乌长风还命令自己的军队要注意维护和当地回民保持关系，不要激化汉回之间的矛盾。

但是随着林盛和的新命令到达，及关中平原对汉人的屠杀事件爆发之后，乌长风迅速转变了态度。

一方面他命令一个军9千人先行赶赴关中平原，阻止当地的屠杀事件，另一方面则把部队分成3部分，北路进入宁夏，中路进入甘肃，南路支援关中平原。